Hab den Fehler gefunden. Es hatte in diesem Fall nichts mit dem Webserver oder PHP zu tun, sondern mit der DDoS Protection. Diese war auf "Layer 7" und nicht auf "Sensor Mode" eingestellt. Layer 7 ist eigentlich optimiert für Webserver, aber in dem falle kommt PHP irgendwie nicht damit klar. Trotzdem danke für die Hilfe!